La materia orgánica junto con las arcillas por su tamaño (<2 µm), son consideradas coloides y poseen cargas negativas que se generan por sus raciales orgánicos, también tienen la capacidad de atraer cationes (Ca2+, Mg2+, K+, H+, Na+, NH4+), retener agua y oxigeno en el suelo y mejorar la rizósfera para un mayor, mejor desarrollo y nutrición vegetal.

Los diferentes orígenes y climas de suelos determinan el tipo de materia orgánica presente en ellos y su cantidad. Las condiciones edafoclimáticas frías tienden a conservar mayores concentraciones de material orgánico por su lenta rata de mineralización, mientras que en condiciones templadas a cálidas, estas ratas de mineralización se incrementan disminuyendo el contenido de materia orgánica sobre todo en ecosistemas de producción agrícola intensiva en donde se requieren prácticas de incorporación de residuos de cosecha y suministro de fertilizantes nitrogenados entre otros para obtener óptimas productividades.

La materia orgánica del suelo presenta un comportamiento similar al de las arcillas en la capacidad de intercambio catiónico (CIC), por retener e intercambiar cationes. Gracias a esta propiedad los nutrientes tanto naturales como los aplicados mediante Planes Integrales de Fertilización no se lavan fácilmente o lixivian para luego gradualmente ser liberados a la solución del suelo y absorbidos por las raíces de las plantas. La unidad de medición de la materia orgánica es en porcentaje (%) y su método analítico de extracción en laboratorio es Walkley-Black.

Es importante tener en cuenta que al suministrar materiales de origen orgánico como gallinazas, bovinazas, porquinazas etc, usadas como correctivos orgánicos en los suelos, se requiere de un previo análisis bioquímico, debido a que de no presentar un óptimo grado de humedad y madurez de estos materiales (microorganismos), en lugar de contribuir a un mejoramiento de las condiciones orgánicas del suelo, se genera un problema fitosanitario muy delicado y se disminuye la eficiencia de la fertilización mineral por ser consumida por los materiales orgánicos (N, P) en mal estado de descomposición.